礦產資源在開采作業過程中，重金屬等污染物較易進入土壤和水體，隨著時問的推移易富集累積造成污染，使土壤的性質和功能改變，影響植被的生長發育，嚴重的會使植物死亡。水體中的污染物會隨著地下水或地表水的流動遷移至較大范圍內，最終可能會影響到人類的生產生活。由于土壤及地下水污染具有隱蔽的特點，不易被發現，當影響到植被的生長和人們的生活時，污染往往已經達到比較嚴重的程度，修復難度加大。水體的污染主要是礦坑水和尾礦水灌溉或泄漏引起的。污染物經地下和地表水系擴散，所形成的污染羽通常是沿河流呈枝狀或片狀分布。

礦山修復中一個很重要的環節是礦區土壤質量的改善，主要包括礦區周邊土壤環境的治理改善，壓占土地的恢復，裸露山體表面土壤的回覆。礦產開采引起的土壤污染采用物理、化學、生物等方法治理。土壤基層的改良可以在其他區域取適量土壤回覆到礦山土壤受損較嚴重的區域，使植物能夠正常生長，植物的生長一方面促進了土壤質量的改善，另一方面又可以起到穩固土層的效果。在改善土壤和綠化的過程中，可以在貧瘠的土壤中人為添加改良劑，做好土壤的增肥工作，提高土壤的物理和化學性能，使植物成活率得到保障，為后期礦山的長期穩定恢復奠定基礎。土壤質量的提高，植被的恢復又可以起到涵養水源的作用，使礦區的生態進入良性的循環和發展。

礦山開采過程破壞了山體原有的結構，形成大量邊坡，治理修復可以將陡峭的邊坡進行修整，清理多余的碎石，消除安全隱患，有效地穩定邊坡。在山體治理時通常會將山體的邊坡坡度降低，這樣可以減少山體崩塌的風險，之后再布設植物措施，提高項目區植被覆蓋率，有效地增強水土保持的功能，使破壞的山體得到恢復。